آيت اللَّه شيخ محمد ابراهيم اعرافی پس از رحلت آيت اللَّه حكيم، رسماً امام خمينی را به عنوان تنها مرجع تقليد معرفی نمود و با شروع انقلاب اسلامی ايران به رهبری مبارزات مردم استان يزد پرداخت و با شروع جنگ تحمیلی کاروان‌هاى جبهه را تشویق و کمکهاى مردمى را به سوى جبهه‌ها گسیل مى‌داشت.؛